La ricerca bibliografica per Medicina

La ricerca bibliografica per
Medicina: cercare articoli
online con MetaBib e
PubMed
a cura di Laura Colombo
Università degli Studi di Milano-Bicocca
Monza, a.a. 2012/2013
Sommario
La ricerca bibliografica
Fase I: il quesito clinico, la definizione del PICO, la scelta delle
parole chiave
Fase II: individuazione del materiale cercato e scelta degli
strumenti
Fase III: interrogazione degli strumenti
PubMed
MetaBib
La ricerca bibliografica
Il progetto di ricerca
Fase I
Fase II
Fase III
Definizione del
Quesito clinico
Individuazione del
Materiale cercato
(libri, articoli, doc. vari)
Interrogazione degli
Strumenti di ricerca
Scelta dei criteri di
validità dei doc. cercati
(attendibilità delle
fonti, periodo
circoscritto ecc.)
Affinamento della
ricerca e uso di vari
criteri di ricerca (CDD,
soggetti, descrittori,
operatori booleani,
caratteri speciali)
Scelta degli
Strumenti (cataloghi,
banche dati, motori di
ricerca ecc.)
Selezione dei risultati e
creazione di una
bibliografia ragionata
Elaborazione del PICO
Individuazione degli
argomenti da
approfondire e delle
Parole chiave
La ricerca bibliografica
Il quesito clinico
Il problema clinico dev’essere trasformato
in una domanda precisa (quesito clinico),
in modo da poter trovare una risposta
pertinente.
La ricerca bibliografica
PICO
Per definire al meglio l’argomento della ricerca,
il metodo migliore è crearsi il PICO:
P: paziente o popolazione
I: intervento
C: comparazione
O: outcome (esito)
La ricerca bibliografica
Le parole chiave
Individuo le parole chiave più importanti.
Per individuare le parole più efficaci per la mia ricerca, posso
aiutarmi con una checklist:
• Scrivo tutti i sinonimi, le varianti ortografiche
(inglese/americano), i termini equivalenti che mi vengono
in mente.
• Se la ricerca comprende anche materiale in inglese,
traduco le parole chiave.
Attenzione! Non mi limito ad una traduzione letterale ma
cerco il termine tecnico più adatto ad esprimere il concetto.
• Se i termini sono noti anche come sigle o abbreviazioni o
acronimi, mi annoto anche questi.
La ricerca bibliografica
Materiale cercato e Scelta degli strumenti
• Libri (monografie)
se ho bisogno di: una panoramica di insieme, informazioni su
un argomento vasto o generale
dove cerco: cataloghi (OPAC Bicocca, SBN)
• Articoli di riviste (periodici)
se ho bisogno di: argomenti molto specifici, approfondimenti,
notizie recenti etc.
dove cerco: banche dati italiane e straniere (MetaBib)
• Letteratura grigia (tesi, atti di convegni, norme,
linee guida, ecc.)
se ho bisogno di: informazioni estremamente specifiche e/o
recenti
dove cerco: banche dati (MetaBib) e web
La ricerca bibliografica
Cataloghi: CDD e classificazione
• CDD (Classificazione Decimale Dewey)
suddivisione del sapere in:
– 10 classi: es. 100 filosofia e psicologia, 300 scienze sociali,
500 scienze naturali e matematica, 600 tecnologia
– 100 divisioni (10 per ogni classe): es. 610 medicina e
salute, 620 ingegneria e attività affini
– 1000 sezioni: 611 anatomia citologia e istologia umana, 612
fisiologia umana
– eventuali gradi di classificazione dopo la terza cifra, seguita
da un punto: 612.8 FISIOLOGIA UMANA. FUNZIONI
NERVOSE FUNZIONI SENSORIE
NB. Utile anche per la ricerca a scaffale! [in Bicocca scaffale
aperto]
La ricerca bibliografica
Descrittori
• Quasi tutte le banche dati hanno al proprio interno un vocabolario
Thesaurus (o vocabolario controllato) creato da esperti nella materia.
• Il vocabolario più importante per la Medicina è il MeSH Database
di PubMed creato dalla National Library of Medicina (NLM) e
continuamente aggiornato.
• L’ISS in collaborazione con la NLM ha tradotto in italiano il
vocabolario. http://www.iss.it/site/Mesh/
Si può ricercare partendo dall’italiano o dall’inglese. Non sono ancora
stati tradotti tutti i sinonimi. In caso di mancato reperimento di un
termine, pensiamo a possibili sinonimi oppure utilizziamo l’operatore di
troncamento * sia a sinistra che a destra del termine cercato.
La ricerca bibliografica
Operatori booleani
Collego le parole chiave attraverso legami logici.
Analizzo le parole che ho trovato:
• Ce ne sono due o più che devono esserci in tutti i
documenti che mi servono?
• Voglio cercare due o più parole che sono sinonimi?
• Ce n’è qualcuna che potrebbe essere associata ma che mi
porterebbe in un campo che non mi interessa?
Queste condizioni possono essere indicate attraverso gli
operatori booleani, rispettivamente AND, OR, NOT.
La ricerca bibliografica
Parentesi e Caratteri speciali
Parentesi (): nelle ricerche più complesse è consigliabile
utilizzare le parentesi per stabilire un ordine di priorità nella
lettura della stringa di ricerca. In assenza di parentesi il sistema
legge da sinistra a destra.
Troncamento (asterisco *): i termini da ricercare possono
essere troncati con questo simbolo. In questo modo vengono
ricercate tutte le varianti che iniziano con la stessa radice.
Virgolette «»: i termini inclusi vengono cercati come frase.
PubMed
Profilo
• Banca dati bibliografica (free on line dal 1996)
– ente: National center for biotechnology and information (NCBI),
divisione della National Library of Medicine (NLM), USA
– ambiti tematici: medicina, infermieristica, odontoiatria, medicina
veterinaria, organizzazione sanitaria, scienze pre-cliniche, farmacia
– copertura: dal 1879 ad oggi (più di 21 milioni di record)
– documenti selezionati: riviste ed e-book
– tipi di ricerca: Libera (base e avanzata), per MeSH (= thesaurus)
– informazioni sui documenti: descrizione bibliografica, abstract,
MeSh di PubMed, tanti full text
Il nucleo di PubMed è Medline che forma la parte più consistente
delle citazioni presenti
Presentazione record dal più recente, rilevante, ecc.
MeSH ricco, interrogabile in vari modi ed esplicativo
Tante funzioni per raffinare la ricerca e salvare i record (v.
Tutorials)
PubMed
Accesso
La versione free è disponibile all’indirizzo:
www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
Se accediamo a PubMed dall’Università o autenticandoci da casa,
entriamo in MetaBib (Biblioteca Digitale), selezioniamo “Trova
banche dati” e scegliamo PubMed. Si attiverà il bottone
vedremo se possiamo accedere a quell’articolo in full text.
e
PubMed
Ricerca nel MeSH
• VANTAGGI:
I risultati sono pertinenti
e non devo pensare a
tutti i sinonimi.
• SVANTAGGI:
Non si trovano gli
articoli più recenti, non
ancora indicizzati.
Il tempo richiesto per
l’inserimento in MEDLINE
varia da 15 giorni a due
mesi.
E’ consigliabile iniziare sempre la ricerca
nel MeSH Database (il thesaurus o
vocabolario controllato di PubMed).
PubMed
Il MeSH Database
Il MeSH ha una struttura ad albero. Si parte da categorie molto
ampie per arrivare a soggetti (descrittori) sempre più specifici.
E’ possibile scegliere se:
• Limitare la ricerca al termine più ampio (Restrict to MeSH Major
Topic).
• Non esplodere nella ricerca ogni termine anche ai termini
sottostanti (Do Not include MeSh terms found below this term…).
PubMed
I Subheadings del MeSH
Sono termini che qualificano l’aspetto di un descrittore MeSH.
E’ possibile spuntare uno o più Subheadings.
Per lanciare la ricerca cliccare su «Add to search builder».
La ricerca verrà portata dentro il riquadro.
Basterà cliccare su “Search PubMed” per vedere i risultati.
PubMed
Ricerca libera (1)
• VANTAGGI:
Si trovano gli articoli più
recenti, non ancora
indicizzati.
• SVANTAGGI:
Si trovano spesso troppi
articoli, molti non
pertinenti. Dobbiamo
pensare ai sinonimi e alle
forme varianti e utilizzare
gli operatori booleani
e i caratteri speciali.
E’ consigliabile fare
sempre anche la ricerca
libera.
PubMed
Ricerca libera (2)
• OPERATORI BOOLEANI
Se non vengono inseriti i booleani, viene sottinteso AND.
PubMed li processa da sinistra a destra; per alterare tale ordine è
necessario inserire tra parentesi tonde i termini che si vuole siano
processati per primi.
• CARATTERI SPECIALI
*: Il carattere di troncamento * cerca tutti i termini che iniziano con
una determinata radice individuando fino a 600 variazioni.
“”: Le virgolette indicano al sistema di ricercare l’intera frase.
NB: disattivano la ricerca automatica nel Mesh
• SINONIMI E VARIANTI
Alcuni termini in inglese e in americano si scrivono diversamente.
PubMed
I limiti
Dalla pagina dei risultati è possibile
aggiungere dei filtri per limitare i
risultati di una ricerca utilizzando una
serie di possibili criteri.
NB: Automaticamente se ne attivano
alcuni. Per attivare gli altri cliccate su
«Show addictional filters». Tra questi:
Journal categories: sono dei gruppi di
riviste costituiti in base all’area
disciplinare di cui le riviste si occupano
(es. Nursing Journals o Dental Journals)
Ages: dal neonato all’anziano
Sex: maschio o femmina
PubMed
Ricerca combinata
Serve per combinare più ricerche (fatte con 2 MeSh o 2 ricerche libere
o 1 MeSH e 1 libera).
Nella History (clicca su Advanced search per accedervi) si vedono le
ricerche fatte che si uniscono scrivendo #(numero ricerca) operatore
booleano #(numero ricerca).
PubMed
I risultati della ricerca (1)
• Di default vengono visualizzati 20 risultati per pagina. E’ possibile
cambiare questa opzione utilizzando il menu a discesa “Display
Settings”, Items per page.
• Gli articoli vengono ordinati per data (dal più recente). E’ possibile
cambiare questa opzione utilizzando il menu a discesa “Display
Settings”, Sort By.
PubMed
I risultati della ricerca (2)
Filter your results:
Per guardare solo gli
articoli free o le revisioni.
Titles with your search terms:
per trovare articoli che hanno nel
titolo i termini cercati
Search details:
ti mostra i termini Mesh e le
parole libere cercate
PubMed
Accedere al full text (1)
Cliccando sul titolo dell’articolo, si vede la citazione completa.
Spesso c’è il link all’editore. E’ visibile
il full text se la rivista è free.
Cliccando su SFX si accede alla pagina
dei servizi Bicocca- Insubria che
permette di sapere se l’articolo è
consultabile in formato elettronico o
cartaceo e accedere ai servizi avanzati.
PubMed
Accedere al full text (2)
• Articolo disponibile in
elettronico: si vedono gli
Editori.
• Articolo disponibile in cartaceo:
trovi la scritta «E’ presente».
• Articolo non disponibile in
Biblioteca di Ateneo:
Richiesta di Document
Delivery.
PubMed
Il Record PubMed
• MeSH terms: riporta i descrittori dell’articolo.
• Related citations:
articoli correlati
all’argomento.
Funzione utile
quando la ricerca
iniziale da pochi
risultati.
• LinkOut: riporta siti gratuiti sull’argomento.
PubMed
Altri tipi di ricerche (1)
• PMID:
l’identificativo
del record
• Single Citation Matcher:
•
per trovare una citazione di cui
si hanno alcuni dati (es. autore,
parole del titolo, nome della
rivista)
Topic-Specific Queries:
per fare ricerche cliniche
o per argomento (anche
per accedere a
MedlinePlus)
PubMed
Altri tipi di ricerche (2)
Clinical Trials: archivio
dei trial clinici in corso
Journal Database:
archivio di titoli di riviste
biomediche completi di
ISSN e rimandi alle
possibili abbreviazioni
PubMed
Salvataggio (1)
E’ possibile salvare i risultati in un file testo (File) o spedirseli
per e-mail (E-mail) o salvarli temporaneamente (8 ore) nella Clipboard.
PubMed
Salvataggio (2)
Per salvare in modo permanente le strategie di ricerca:
• Registrarsi in My NCBI.
• Una volta identificati, lanciare la ricerca. Salvarla cliccando su Save
Search.
Per creare collezioni (raccolte di articoli):
• Registrarsi in My NCBI.
• Una volta identificati, lanciare la ricerca. Spuntare gli articoli di
interesse. Cliccare su Send to Collections.
PubMed
Alert ed RSS
Per creare un alert:
•
Registrarsi in My NCBI.
• Una volta identificati, lanciare la ricerca. Salvarla cliccando su
Save Search.
• Scegliere di avere aggiornamenti (e-mail update).
Per ricevere nel proprio Reader gli aggiornamenti:
•
Lanciare la ricerca in PubMed. Cliccare su RSS, Create RSS, XML.
• Se si usa Mozilla Firefox, si apre il Segnalibri Live.
• Se si usa Internet Explorer, utilizzare un reader (es. google
Reader).
PubMed
Tutorial
Dalla Home page di PubMed, nella sezione Using PubMed, si trovano i
PubMed Tutorials, per imparare meglio l’utilizzo di PubMed (in
inglese).
PubMed
Per approfondire…
• Nella Sede di Medicina della Biblioteca ci sono i libri:
Salvatore C. (2007) Conoscere e usare Pubmed.
Guida al più noto sistema di ricerca bibliografica
in campo Biomedico. Roma: Il pensiero scientifico.
Bassi C. (2010) PubMed : istruzioni per l’uso.
Roma: Il pensiero scientifico
•
Alcuni siti internet con guide:
NUOVA INTERFACCIA DI PUBMED
Alma Mater Studiorum Università di Bologna, Facoltà di Medicina e
Chirurgia, Biblioteca Centralizzata Clinica
http://www.biblioteche.unibo.it/clinica/files/nuovo_pubmed.pdf
Per saperne di più…
Riferimenti della Biblioteca di Ateneo
vai nella Sede di Medicina
edificio U8 (Monza), piano terra
visita MetaBib
sul sito www.biblio.unimib.it
scrivici
[email protected]
contattami (reference per medicina)
[email protected] - 02/6448.8011
MetaBib
Che cosa è
MetaBib è un meta-motore di ricerca che offre
un
unico
punto
d’accesso
alle
risorse
elettroniche della biblioteca:
• le banche dati
• le riviste elettroniche
• il catalogo online (OPAC)
• l’archivio aperto (BOA)
• il repertorio di risorse gratuite online (LINX)
Inoltre con MetaBib puoi interrogare direttamente
altre risorse importanti per la ricerca quali
motori di ricerca (Google Scholar, Scirus), portali,
ecc.
MetaBib
A cosa serve
MetaBib, oltre a gestire l’accesso alle risorse
elettroniche, collega gli strumenti per la ricerca
bibliografica disponibili tramite la Biblioteca
attraverso un’unica interfaccia.
Tra le funzioni più importanti di MetaBib ci sono:
• la possibilità di interrogare più banche dati
simultaneamente, con ricerca semplice e
avanzata.
• l’accesso al full text o il collegamento
alla
pagina dei servizi SFX, per capire dove si trova il
documento.
• un’area per personalizzare lo strumento e
salvare risorse, ricerche e risultati.
MetaBib
Come si accede [1]
MetaBib
Come si accede [2]
Tutti gli utenti dell’Università degli Studi di Milano
Bicocca (con indirizzo e-mail istituzionale) possono
accedere a MetaBib anche “da casa”, cioè da
computer esterni alla rete di Ateneo.
Le istruzioni si trovano alla pagina web:
http://www.biblio.unimib.it/go/Home/Home/Risors
e-elettroniche/Accesso-da-casa
MetaBib
Ricerca rapida [1]
Ti permette di interrogare gruppi di risorse per le
diverse aree disciplinari, scelte dai bibliotecari tra
le più usate e chiamate quickset.
Vantaggi: puoi ottenere una panoramica veloce del
tuo argomento ed eventualmente individuare la
banca dati più adatta per un approfondimento.
Risultati della ricerca: documenti (articoli, atti di
convegno, ecc.) o schede bibliografiche con
abstract e riferimenti bibliografici.
MetaBib
Ricerca rapida [2]
Banche dati
che compongono il quickset di medicina
Esempio di ricerca di articoli e documenti
tra le banche dati principali di Medicina
MetaBib
Risultati della ricerca [1]
Dopo aver cliccato su “Visualizza i risultati”, puoi
visualizzare i record delle risorse compatibili con
MetaBib.
I record sono:
• ordinati per rilevanza
• visualizzati in formato uniforme
• de-duplicati (i record comuni a più banche dati
appaiono una volta sola)
• visualizzabili secondo diversi filtri (argomento,
data, soggetto, autore, rivista, banca dati etc.)
MetaBib
Risultati della ricerca [2]
MetaBib
SFX [1]
Click sul pulsante SFX (
)
per accedere al menù dei servizi
N.B. Per EndNoteWeb vedi pagina Banche Dati sul
sito della Biblioteca di Ateneo
MetaBib
SFX [2]
Tutti i risultati visibili in MetaBib sono compatibili con
SFX (software che cerca i dati dell’articolo tra le
risorse disponibili in Biblioteca).
Per ogni risultato relativo agli articoli quindi sono
disponibili i seguenti servizi:
• accesso al full text, se posseduto*
• controllo delle copie cartacee sul catalogo (OPAC)
• ricerca dell’articolo in ACNP (catalogo nazionale dei periodici)
• richiesta di servizi interbibliotecari
• informazioni su autore e periodico
• collegamento a EndNote Web (software di gestione bibliografie)
* Nel caso di testi contenuti in e-book, non c’è il pulsante SFX, ma il full text è
comunque accessibile tramite il Link esterno
MetaBib
Ricerca multipla [1]
Puoi interrogare simultaneamente più risorse, tra
quelle compatibili con MetaBib (segnalate con
).
Sono disponibili sia la ricerca semplice sia la ricerca
avanzata (per titolo, autore etc.).
Vantaggi: puoi scegliere quali banche dati
interrogare insieme. Puoi cercare per materia e per
categoria/sotto-categorie.
Risultati della ricerca: documenti (articoli, atti di
convegno, etc.) o schede bibliografiche con abstract
e riferimenti bibliografici.
MetaBib
Ricerca multipla [2]
MetaBib
Trova riviste [1]
Per individuare una rivista elettronica puoi usare la
funzione Trova Riviste e cercare per Titolo della
rivista. Se vuoi cercare per ISSN (il numero che
identifica i periodici a livello internazionale) vai su
Trova.
MetaBib
Trova riviste [2]
L’elenco delle riviste elettroniche comprende
tutte le riviste a cui è abbonata la Biblioteca di
Ateneo più una selezione di riviste gratuite.
Puoi aprirle direttamente sul sito dell’editore e
sfogliarne l’indice (browse, all issues, issue list,
archives) o fare una ricerca per parola chiave
(funzione search). La grafica e le funzioni della
maschera
di
ricerca
variano
a
seconda
dell’editore.
MetaBib
Trova riviste [3]
Quando vuoi sapere dove si trova un articolo di
cui conosci tutti i dati bibliografici, puoi usare la
funzione Trova Riviste – Cerca la citazione.
E’ una scorciatoia per interrogare in una volta sola
diversi cataloghi:
• il catalogo on line (OPAC) della Biblioteca;
• la lista delle riviste elettroniche della Biblioteca;
• il catalogo nazionale dei periodici (ACNP).
Il programma è sempre SFX, con il menù già visto.
MetaBib
Trova riviste [4]
Esempio di citazione bibliografica di un articolo:
Myxoma is not a single entity: a review of the concept of myxoma.
Allen PW.
Ann Diagn Pathol. 2000 Apr;4(2):99-123. Review.
PMID: 10760324 [PubMed - indexed for MEDLINE]
CITAZIONE DA PUBMED
Allen PW. (2000) Myxoma is not a single entity: a review of the
concept of myxoma. Annals of diagnostic pathology, 4(2): 99-123
CITAZIONE IN FORMATO HARVARD
Ovvero
Cognome e iniziale del nome dell’ autore (anno) Titolo articolo.
Titolo rivista, n. volume o annata(n. fascicolo): n pp
MetaBib
Trova riviste [5]
Cerca per PubMed id
MetaBib
Trova banche dati [1]
Per cercare una banca dati, un catalogo o un’altra
risorsa, usa la funzione Trova banche dati:
• per Nome, se sai già quale ti serve
• per categoria (e sotto-categoria) o per termine
libero, se vuoi scoprire le risorse migliori per la tua
ricerca
Cataloghi on line
Enciclopedie
Pacchetti di riviste
elettroniche
Motori di ricerca
Banche dati
…e altro ancora
Trova banche dati
MetaBib
Trova banche dati [2]
MetaBib
Trova banche dati [3]
Le banche dati bibliografiche sono archivi
organizzati di riferimenti bibliografici.
Alcune di queste possono comprendere il testo
integrale degli articoli (full text) e non solo il riassunto
(abstract).
Vantaggi: allargano il campo della ricerca a ciò che è
stato pubblicato, non solo a quello che possiede la
biblioteca.
Risultati della ricerca: schede bibliografiche.
N.B.: se non c’è il full-text, bisogna poi individuare le
biblioteche che possiedono il documento cercato
attraverso il pulsante SFX
MetaBib
Area personale [1]
Nell’Area personale è possibile:
• crearsi dei quickset su misura (anche mettendo
insieme risorse di categorie differenti) salvando le
proprie risorse preferite e raggruppandole in set
• ripetere e raffinare le ricerche precedenti
• salvare le proprie risorse preferite o anche
singoli record
NB. Help on line per scoprire tutte le funzioni di
MetaBib! Click su
MetaBib
Area personale [2]
Identificati cliccando sul
lucchetto (utilizza come
Login e password le stesse
di webmail)
Vai su Trova banche dati e
spunta le risorse preferite
MetaBib
Area personale [3]
Torna nell’Area Personale, Banche dati
preferite.
Clicca sulla freccia per aggiungere una
risorsa al nuovo quick set
Salva il nuovo set dandogli
un nome
MetaBib
Area personale [4]
Dopo esserti identificato, dalla
pagina della ricerca rapida vedrai
anche i tuoi set personali
MetaBib
Area personale [5]
Le
ritroverai
nelle varie
sezioni
della tua
area
personale
Per salvare
una risorsa o
la scheda di
un articolo,
dopo esserti
identificato
spunta la
cartellina
MetaBib in breve
• Vuoi cercare direttamente articoli e documenti?
Vai su Ricerca rapida, Ricerca multipla o crea il
tuo set nell’Area personale
• Vuoi scegliere una banca dati su cui effettuare
una ricerca approfondita?
Vai su Trova banche dati
• Vuoi sapere dove si trova un articolo di cui
conosci già l’esistenza?
Vai su Trova riviste – Cerca la citazione
Per saperne di più…
Riferimenti della Biblioteca di Ateneo
•
•
•
vieni in biblioteca
Sede Centrale: edificio U6, II piano
Sede di Scienze: edificio U2, I piano
Sede di Medicina: edificio U8, piano terra
visita il sito web
www.biblio.unimib.it
scrivici
[email protected]