SALVATORE ALAIMO Progettazione, sviluppo ed uso di software

Curriculum Vitae
SALVATORE ALAIMO
INFORMAZIONI PERSONALI
SALVATORE ALAIMO
Via Eolo n. 1, 95037, San Giovanni la Punta, CT, IT
+39 095 7177223
+39 349 3019274
[email protected]
http://www.alaimos.com
Skype alaimos
Sesso Maschile | Data di nascita 29/08/1988 | Nazionalità Italiana
OCCUPAZIONE DESIDERATA
SETTORE PROFESSIONALE
Progettazione, sviluppo ed uso di software per l’analisi dei dati con
preferenza per la ricerca in ambito Bioinformatico.
ESPERIENZA
PROFESSIONALE
01/01/2015 – 31/12/2015
Affiliato ad Ente di ricerca
Gruppo Nazionale per il Calcolo Scientifico – Istituto Nazionale di Alta Matematica “Francesco Severi”
– Piazzale Aldo Moro, 5 – Roma
▪ Qualifica: Dottorando
02/01/2013 – 31/10/2015
Dottorato di Ricerca in Informatica
Dipartimento di Matematica e Informatica – Università degli Studi di Catania – P.zza dell’Università, 2
– Catania
▪ Qualifica: Dottorando
01/10/2009 – 31/01/2010
Stage
Facoltà di Giurisprudenza – Università degli Studi di Catania – Via Crociferi 91 – Catania
▪ Qualifica: Analista/Programmatore
ISTRUZIONE E FORMAZIONE
08/02/2016
Dottorato di Ricerca in Informatica (XXVIII Ciclo)
Dipartimento di Matematica e Informatica – Università degli Studi di Catania – P.zza dell’Università, 2
– Catania
Titolo tesi: “From diagnosis to therapy: algorithmic methodologies for precision medicine”
08/11/2012
Laurea Magistrale in Informatica
Dipartimento di Matematica e Informatica – Università degli Studi di Catania – P.zza dell’Università, 2
– Catania
Titolo tesi: “Una libreria in R per la predizione di associazioni tra geni, pathway, microRNA e Drug”
Votazione: 110 e lode
22/07/2010
Laurea Triennale in Informatica
Dipartimento di Matematica e Informatica – Università degli Studi di Catania – P.zza dell’Università, 2
– Catania
Titolo tesi: “Analisi del Protocollo RTP”
Votazione: 110 e lode
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SALVATORE ALAIMO
BORSE DI STUDIO
02/01/2013 – 31/10/2015
Borsa di studio assegnata dall’Università degli Studi di Catania per il
Dottorato di Ricerca in Informatica (XXVIII Ciclo).
COMPETENZE PERSONALI
Lingua madre
Italiana
Altre lingue
COMPRENSIONE
Ascolto
Inglese
C1
PARLATO
PRODUZIONE SCRITTA
Lettura
Interazione
Produzione orale
C2
C1
C1
C1
Certificazione TOEFL conseguito in data 16 novembre 2012
Capacità e competenze sociali
Competenze organizzative e
gestionali
Buona capacità di lavorare in gruppo, maturata in situazioni in cui era indispensabile la collaborazione
tra figure di diversa natura, e con esigenze più disparate
Capacità di lavorare in situazioni di stress, buona attitudine alla gestione di progetti e gruppi.
Competenza digitale
AUTOVALUTAZIONE
Elaborazione
delle
informazioni
Comunicazione
Creazione di
Contenuti
Sicurezza
Risoluzione di
problemi
Utente Avanzato
Utente Avanzato
Utente Avanzato
Utente Avanzato
Utente Avanzato
Altre capacità informatiche:
Conoscenza avanzata degli applicativi di produttività aziendale e personale più comuni (Suite
Microsoft Office, OpenOffice).
Conoscenza avanzata dei linguaggi di programmazione PHP, C#, Java, SQL.
Conoscenza avanzata dei linguaggi di markup HTML, XHTML e XML.
Conoscenza avanzata degli ambienti Matlab ed R.
Conoscenza di base dei linguaggi di programmazione C, C++, Objective-C, ASP 3.0
Conoscenze avanzate di amministrazione di sistemi operativi Linux, Microsoft Windows e Apple
Conoscenze avanzate di amministrazione di applicativi server Apache, Microsoft IIS, MySql,
Microsoft SQL Server, IBM DB2, Microsoft Exchange
Altre competenze
Patente di guida
Sostenuto in data 16/11/2012 esame TOEFL per la certificazione della conoscenza della lingua
Inglese. Votazione 98 su 120.
Automobilistica (patente B)
ULTERIORI INFORMAZIONI
Premi Ricevuti
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Premio Archimede 2013 conferito dal Dipartimento di Matematica e Informatica – Università
di Catania per la migliore tesi sperimentale in Informatica nell’anno accademico
Visite ad istituzioni accademiche
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Dal 02/06/2015 al 02/07/2015 presso il Courant Institute of Mathematical Sciences, New
York University, New York (USA) con il Prof. Dennis Shasha
Dal 25/05/2013 al 25/06/2013 presso il Courant Institute of Mathematical Sciences, New
York University, New York (USA) con il Prof. Dennis Shasha
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SALVATORE ALAIMO
Pubblicazioni Scientifiche
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Eduati F, Mangravite L, Wang T, Tang H, Bare J, Huang R, Norman T, Kellen M, Menden M,
Yang J, Zhan X, Zhong R, Xiao G, Xia M, Abdo N, Kosyk O, Friend S, Stolovitzky G, Dearry
A, Tice R, Huang R, Xia M, Simeonov S, Abdo N, Kosyk O, Rusyn I, Wright F, Wang T, Tang
H, Zhan X, Yang J, Zhong R, Xiao G, Xie Y, Tang H, Yang J, Wang T, Xiao G, Xie Y,
ALAIMO S., Amadoz A, Ammad-ud-din M, Chloé-Azencott A, Bacardit J, Barron P, Bernard
E, Beyer A, Bin S, van Bömmel A, Borgwardt K, Brys A, Caffrey B, Chang J, Chang J,
Christodoulou E, Clément-Ziza M, Cohen T, Cowherd M, Demeyer S, Dopazo J, Elhard J,
Falcao A, Ferro A, Friedenberg D, Giugno R, Gong Y, Gorospe J, Granville C, Grimm D,
Heinig M, Hernansaiz R, Hochreiter S, Liang-Huang C, Huska M, Jiao Y, Klambauer G,
Kuhn M, Kursa M, Kutum R, Lazzarini N, Lee I, Leung M, Lim K W, Liu C, López F L,
Mammana A, Mayr A, Michoel T, Mongiovì M, Moore J, Narasimhan R, Opiyo S, Pandey G,
Peabody A, Perner J, Pulvirenti A, Rawlik K, Reinhardt S, Riffle C, Ruderfer D, Sander A,
Savage R, Scornet E, Sebastian-Leon P, Sharan R, Simon-Gabriel C, Stoven V, Sun J, Tang
H, Teixeira A, Tenesa A, Jean-Vert P, Vingron M, Wang T, Walter T, Whalen S, Wisniewska
Z, Wu Y, Xiao G, Xie Y, Xu H, Yang J, Zhan X, Zhang S, Zhao J, W Zheng J, Zhong R, Ziwei
D, Friend S, Dearry A, Simeonov A, Raymond R Tice, Rusyn I, Wright F, Stolovitzky G, Xie
Y, Saez-Rodriguez J (2015). Prediction of human population responses to toxic
compounds by a collaborative competition. NATURE BIOTECHNOLOGY, vol. 33; p.
933-940, ISSN: 1087-0156, doi: 10.1038/nbt.3299
Nigita G, ALAIMO S., Ferro A, Giugno R, Pulvirenti A (2015). Knowledge in the
investigation of A-to-I RNA editing signals. FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND
BIOTECHNOLOGY, ISSN: 2296-4185, doi:10.3389/fbioe.2015.00018
ALAIMO S., Bonnici V, Cancemi D, Ferro A, Giugno R, Pulvirenti A (2015). DT-Web: a webbased application for drug-target interaction and drug combination prediction
through domain-tuned network-based inference. BMC SYSTEMS BIOLOGY, vol. 9,
ISSN: 1752-0509, doi: 10.1186/1752-0509-9-S3-S4
ALAIMO S., Giugno R, Pulvirenti A (2014). ncPred: ncRNA-Disease association
prediction through tripartite network based inference. FRONTIERS IN
BIOENGINEERING
AND
BIOTECHNOLOGY,
ISSN:
2296-4185,
doi:
10.3389/fbioe.2014.00071
ALAIMO S., Pulvirenti A, Giugno R, Ferro A (2013). Drug-target interaction prediction
through domain-tuned network-based inference. BIOINFORMATICS, vol. 29; p. 20042008, ISSN: 1367-4803, doi: 10.1093/bioinformatics/btt307
Capitoli di Libro
•
ALAIMO S., Giugno R, Pulvirenti A (in press). Recommendation Techniques for Drug–
Target Interaction Prediction and Drug Repositioning. In: Data Mining Techniques for
the Life Sciences.
Lavori sottomessi e in
preparazione
•
ALAIMO S., Giugno R, Acunzo M, Veneziano D, Ferro A., Pulvirenti A (2015).
Post-transcriptional knowledge in pathway analysis increases the accuracy
of phenotypes classification. arXiv preprint arXiv:1510.08237. Oncotarget
Under Review.
Atti in convegni
•
ALAIMO S., Ferragina P, Ferro A, Giugno R, Pulvirenti A (2015) An algorithm for the
prediction of annotations on Pubmed. In: BITS 2015. Milano, Jun 3-5, 2015
Sardina D S, ALAIMO S., Ferro A, Pulvirenti A, Giugno R (2015). Inferring ceRNA
Networks through Recommendation Systems. In: BITS 2015. Milano, Jun 3-5, 2015
ALAIMO S., Bonnici V, Cancemi D, Ferro A, Giugno R, Pulvirenti A (2014). DT-Hybrid Web:
A web-based application for Drug-Target interaction prediction through domain-tuned
network based inference. In: BITS 2014. Roma, 26-28 Febbraio 2014
ALAIMO S., Pulvirenti A, Giugno R, Ferro A (2013). MITHrIL: miRNA enriched Pathway
Impact Analysis. In: BITS 2013. Udine, 21-23 Maggio 2013
Dal 13/07/2013 al 20/07/2013 partecipazione alla Lipari School for Scientific Research su
“Computational Network Biology”
Dal 12/07/2014 al 19/07/2014 partecipazione alla Lipari School for Scientific Research su
“Computational Genomics and Personalized Medicine”
Dal 19/07/2015 al 25/07/2013 partecipazione alla Lipari School for Scientific Research su
“Computational Dynamic Analysis of Biological Processes”
21/07/2015 tutorial presso la Lipari School for Scientific Research con argomento “NextGeneration Sequencing in practice: bioinformatics analysis techniques and some
medical applications”
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Altra attività
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SALVATORE ALAIMO
Data
Firma
25 febbraio 2016
Autorizzo il trattamento dei miei dati personali ai sensi del Decreto Legislativo 30 giugno 2003, n. 196
"Codice in materia di protezione dei dati personali".
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