Emmanouil Athanasakis

Curriculum Vitae
INFORMAZIONI PERSONALI
Emmanouil Athanasakis
Emmanouil Athanasakis
Via Saluzzo 14/A, 33100 Udine, Italia
+39 3471524731
[email protected]
Skype manolis.gr.80
Sesso M | Data di nascita 14/04/1980 | Nazionalità Ellenica
ESPERIENZA
PROFESSIONALE
2014 - presente
Contratto per attività di ricerca
I.R.C.C.S. Burlo Garofalo - Direzione Scientifica
Via dell’Istria 65/1, 34100 Trieste, Italia
Prof. G Zauli
▪ Screening di mutazioni nelle Leucemie Linfatiche Croniche (B-CLL).
▪ Messa a punto di un sistema di analisi dei chimerismi ematologici con qRT-PCR e NGS.
2013 - presente
Attività di ricerca in collaborazione
Università degli Studi di Udine - Dip. di Scienze Mediche e Biologiche
Dottor M. Castronovo
▪ Applicazione di tecniche di analisi degli acidi nucleici allo studio di reazioni enzimatiche in
nanostrutture di DNA.
2012 – 2014
Contratto per attività di ricerca
Università degli Studi di Udine - Dip. di Scienze Mediche e Biologiche
Piazzale Santa Maria della Misericordia 15, 33100 Udine, Italia
Prof. CA Beltrami
▪ Studi Epigenetici e di miRNA sulle cellule staminali cardiache umane.
▪ Isolamento di cellule staminali da cuori umani.
2007 - 2012
Contratti per attività di ricerca
I.R.C.C.S. Burlo Garofalo - Struttura Complessa di Genetica Medica
Via dell’Istria 65/1, 34100 Trieste, Italia
Prof. P Gasparini
▪ Studio di malatie rare
▪ Gestione del laboratorio e dei servizi di genetica medica a carico del Prof. Gasparini
2010 - 2011
Prestazione occasionale
BioTeltec S.r.l.
Via Lecco 4, 20041 Agrate Brianza (MI), Italia
Dott.ssa A Fischetti
▪ Prestazioni di consulenza sulla piattaforma Custom Microarray ECD – Combimatrix, in Italia e in
Francia
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2007 - 2007
Emmanouil Athanasakis
Contratto per attività di apprendimento
I.R.C.C.S. Burlo Garofalo - Struttura Complessa di Genetica Medica
Via dell’Istria 65/1, 34100 Trieste, Italia
Prof. P Gasparini
▪ Gestione del laboratorio e del servizio di sequenziamento
2006 - 2007
Contratto a progetto
Lay Line Genomics S.p.A.
Area Science Park, 34100 Basovizza (TS), Italia
Dott.ssa M Visintin
▪ Preparazione di colture di lievito e di batteri per la loro applicazione nel metodo SPLINT (Single Pot
Libraries of Intracellular Antibodies)
▪ Sequenziamento diretto, gestione degli ordini e del magazzino del laboratorio
2000 - 2006
Contratti di lavoro occasionale e/o a tempo determinato
Trieste, Italia
▪ Barista, Cameriere, Giardiniere, Volantinaggio
ISTRUZIONE E FORMAZIONE
2004 – 2006
Laurea Specialistica in Biotecnologie Mediche
104/110
Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università di Trieste, Italia
Tesi di laurea in Neuroscienze, Relatore prof. G. Leanza
▪ Regolazione colinergica della neurogenesi ippocampale adulta nel ratto. Effetti dell’apprendimento
spaziale
2006 – 2006
Stage in azienda
Biosensor Technologies S.r.l., Trieste, Italia
Referente Prof. A. Savoini
▪ Sviluppo di biosensori per il rilevamento e quantificazione della caffeina
1999 – 2004
Laurea di primo livello in Biotecnologie
100/110
Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università di Trieste, Italia
Tesi di laurea in Immunologia e Microbiologia; Relatore Prof. F. Tedesco, Correlatore Prof. E. A. Tonin
▪ Studio dei possibili meccanismi d’evasione da complemento da parte di ceppi di Burkholderia
cepacia
2003 – 2003
Stage in laboratorio
Laboratorio Nazionale CIB, Area Science Park Padriciano (TS), Italia
Referente Prof. G. Del Sal
▪ Colture cellulari
1998
Maturità scientifica
1° Liceo Galatsiou di Atene, Grecia
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Emmanouil Athanasakis
COMPETENZE PERSONALI
Lingua madre
Greco
Altre lingue
COMPRENSIONE
PARLATO
PRODUZIONE SCRITTA
Ascolto
Lettura
Interazione
Produzione orale
Italiano
C2
C2
C2
C2
C1
Inglese
B1
B1
B1
B1
B1
Competenze comunicative
Competenze organizzative e
gestionali
Competenze professionali
▪ Buona attitudine per il lavoro di gruppo e buone capacità di comunicazione
▪ Buona autonomia nell’organizzazione del lavoro e delle scadenze
▪ Coordinazione e organizzazione di gruppi di lavoro
▪ Tutore in laboratorio di studenti universitari
▪ Colture cellulari
Isolamento di cellule staminali da cuori umani; Colture eucariotiche, batteriche, lievito;
Trasformazioni, Trasfezioni; Cellule competenti
▪ Acidi nucleici
Estrazione/Purificazione degli acidi nucleici; Sanger Sequencing, Next Generation Sequencing;
Realt Time PCR (AQ, RQ); CNV, Genotyping, Microsatelliti; MLPA; Biobanche; Microarray
▪ Proteine
Produzione e Purificazione di proteine, Isolamento di Istoni; Western Blot, E.L.I.S.A.,
Immunoprecipitazione, Test di Attività Enzimatica
▪ Strumenti con relativi software
Ion Torrent PGM, Ion OT + ES, Ion Reporter; ABI Analyzer 3130XL; 7900HT Fast Real-Time PCR
System, LightCycler 480, CFX96 qPCR System; ChemiDoc XRS; Robot Biomek NX MC LAW;
ABanalitica/Micronic Biobanker; CombiMatrix CustomMicroarray-ECD; DHPLC WAVE System
4500HT
▪ Gestione e organizazione del laboratorio
Gestione Preventivi, Ordini, Spedizioni, Magazzino
▪ Ottimizzazione e Automatizzazione di protocolli (tempi e costi)
▪ Gestione di grandi numeri di campioni/reazioni
Competenze informatiche
Altre competenze
▪ Buona conoscenza del pacchetto Office (certificato ECDL)
▪ Buona capacità di utilizzo di motori di ricerca internet e di banche dati biologico / genetiche
▪ Buona capacità di utilizzo di software dedicati per analisi genetiche e biologico-molecolari
▪ Correlatore di tesi di laurea
Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università di Trieste, Laurea di primo livello in Biotecnologie
“Identificazione di polimorfismi genetici di suscettibilità per l’osteoporosi“
“Analisi Molecolare in una coorte Italiana di pazienti con sindrome di Cohen”
“Analisi Molecolare in una coorte Italiana di pazienti con ipoglicemia iperinsulinemica”
Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università di Trieste, Laurea di secondo livello in Biotecnologie
Mediche
“Ottimizzazione della diagnosi genetica delle febbri periodiche mediante tecnologie ad
alto processamento”
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Altre competenze
Emmanouil Athanasakis
Dipartimento di Scienze della Vita, Università di Treste, Laurea di secondo livello in Genomica
Funzionale
“ Valutazione del chimerismo post-trapianto allogenico di cellule staminali ematopoietiche
utilizzando una semi nested q-PCR”
Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università di Trieste, Laurea in Tecnico di Laboratorio Biomedico
“Analisi di Copy Number Variation in pazienti affetti da fibrosi cistica”
Patente di guida
Patente di guida B1 e disponibilità di autovettura
ULTERIORI INFORMAZIONI
Pubblicazioni
Year 2010-2013
Data source: Google Scholar
Papers: 21
Citations: 98
h-index: 5
▪ Athanasakis E*, Licastro D*, Faletra F*, Fabretto A, Dipresa S, Vozzi D, Morgan A, D'Adamo A,
Pecile V, Biarnés X, Gasparini P. "Next Generation Sequencing in Nonsyndromic Intellectual
Disability: from a Negative Molecular Karyotype to a Possible Causative Mutation Detection".
American Journal of Medical Genetics part A 2014, 164A(1):170-176. (*These authors contributed
equally to this work).
▪ Faletra F, D'Adamo AP, Bruno I, Athanasakis E, Biskup E, Esposito L, Gasparini P. "Autosomal
Recessive Stickler Syndrome due to a Loss of Function Mutation in the COL9A3 Gene". American
Journal of Medical Genetics part A 2014, 164A(1):42.47.
▪ Migliore C, Athanasakis E, Dahoun S, Wonkam A, Lees M, Calabrese O, Connell F, Lynch SA, Izzi
C, Pompilii E, Thakur S, Maarle MV, Wilson L, Meroni G. ”Complex rearrangement of the exon 6
genomic region among Opitz G/BBB Syndrome MID1 alterations”. European Journal of Medical
Genetics 2013, 56(8):404-410.
▪ Faletra F*, Athanasakis E*, Morgan A, Biarnés X, Fornasier F, Parini R, Furlan F, Boiani A,
Maiorana A, Dionisi-Vici C, Giordano L, Burlina A, Ventura A, Gasparini P. ”Congenital
hyperinsulinism: Clinical and molecular analysis of a large Italian cohort”. Gene 2013, 521(1):160165. (*These authors contributed equally to this work).
▪ Vozzi D, Licastro D, Martelossi S, Athanasakis E, Gasparini P, Fabretto A. “Alagille Syndrome: a
new missense mutation detected by whole-exome sequencing in a case previously found to be
negative by DHPLC and MLPA”. Mol. Syndromol. 2013, 4(4):207-210.
▪ Faletra F, Snider K, Shyng SL, Bruno I, Athanasakis E, Gasparini P, Dionisi-Vici C, Ventura A, Zhou
Q, Stanley CA, Burlina A. “Co-inheritance of two ABCC8 mutations causing an unresponsive
congenital hyperinsulinism: clinical and functional characterization of two novel ABCC8 mutations”.
Gene 2013, 516(1):122-125.
▪ Licastro D, Mutarelli M, Peluso I, Neveling K, Rispoli R, Vozzi D, Athanasakis E, D’Eustacchio A,
Pizzo M, D’amico F, Ziviello C, Simonelli F, Fabretto A, Gasparini P, Banfi S, Nigro V. “Molecular
diagnosis of Usher syndrome: application of two different Next Generation Sequencing-based
procedures”. PLoS ONE 2012, 7(8):e43799.
▪ Faletra F, D’Adamo P, Pensiero S, Athanasakis E, Catalano D, Bruno I, Gasparini P. “A novel
CRYBB2 missense mutation causing dominant cataract in an Italian family”. Ophthalmic Genet.
2012, 34(1-2):115-117.
▪ Pirastu N, Robino A, Lanzara C, Athanasakis E, Esposito L, Tepper BJ, Gasparini P. “Genetics of
food preferences: a first view from Silk Road populations”. J. Food Sci. 2012, 77(12):S413-418.
▪ Athanasakis E, Biarnés X, Bonati MT, Gasparini P, Faletra F. “Identification of a new mutation
(L46P) on the human NOG gene in an Italian patient with Symphalangism syndrome". Mol.
Syndromol. 2012, 3(1):21-24.
▪ Athanasakis E, Fabretto A, Faletra F, Mocenigo M, Morgan A, Gasparini P. “Two novel COH1
mutations in an Italian patient with Cohen syndrome”. Mol. Syndromol. 2012, 3(1):30-33.
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Pubblicazioni
Year 2010-2013
Data source: Google Scholar
Papers: 21
Citations: 98
h-index: 5
Emmanouil Athanasakis
▪ Bortot B, Athanasakis E, Rizzotti D, Brun F, Mestroni L, Sinagra G, Severini GM. “High-throughput
genotyping robot-assisted method for mutation detection in patients with Hypertrophic
Cardiomyopathy”. Diagn. Mol. Pathol. 2011, 20(3):175-179.
▪ Vozzi D, Aaspõllu A, Athanasakis E, Berto A, Fabretto A, Licastro D, Külm M, Testa F, Trevisi P,
Vahter M, Ziviello C, Martini A, Simonelli F, Banfi S, Gasparini P. “Molecular epidemiology of Usher
syndrome in Italy”. Mol. Vis. 2011, 17:1662-1668.
▪ Faletra F, Athanasakis E, Minen F, Fornasier F, Marchetti F, Gasparini P. “Vertebral defects in
patients with Peters plus syndrome and mutations in B3GALTL”. Ophthalmic Genet. 2011,
32(4):256-258.
▪ Bezzerri V, d'Adamo P, Rimessi A, Lanzara C, Crovella S, Nicolis E, Tamanini A, Athanasakis E,
Tebon M, Bisoffi G, Drumm ML, Knowles MR, Pinton P, Gasparini P, Berton G, Cabrini G.
“Phospholipase C-{beta}3 is a key modulator of IL-8 expression in Cystic Fibrosis bronchial epithelial
cells”. J. Immunol. 2011, 186(8):4946-4958.
▪ Sorice R, Bione S, Sansanelli S, Ulivi S, Athanasakis E, Lanzara C, Nutile T, Sala C, Camaschella
C, D'Adamo P, Gasparini P, Ciullo M, Toniolo D. “Association of a variant in the CHRNA5-A3-B4
gene cluster region to heavy smoking in the Italian population”. Eur. J. Hum. Genet. 2011, 19(5):593596.
▪ Faletra F, Pirastu N, Athanasakis E, Somaschini A, Pianigiani G, Gasparini P. “A novel mutation in
the vWFA2 domain of the COCH gene in an Italian DFNA9 family”. Audiological Medicine. 2011,
Vol.9(1):4–7.
▪ Crovella S, Segat L, Amato A, Athanasakis E, Bezzerri V, Braggion C, Casciaro R, Castaldo G,
Colombo C, Covone AE, De Rose V, Gagliardini R, Lanzara C, Minicucci L, Morgutti M, Nicolis E,
Pardo F, Quattrucci S, Raia V, Ravazzolo R, Seia M, Stanzial V, Termini L, Zazzeron L, Cabrini G,
Gasparini P. “A polymorphism in the 5' UTR of the DEFB1 gene is associated with the lung
phenotype in F508del homozygous Italian cystic fibrosis patients”. Clin. Chem. Lab. Med. 2011,
49(1):49-54.
▪ Pontillo A, Brandão LA, Guimarães RL, Segat L, Athanasakis E, Crovella S. “A 3'UTR SNP in
NLRP3 gene is associated with susceptibility to HIV-1 infection”. J. Acquir. Immune Defic. Syndr.
2010, 54(3):236-240.
▪ Segat L, Morgutti M, Athanasakis E, Trevisiol C, Amaddeo A, Poli F, Crovella S. “Analysis of DEFB1
regulatory SNPs in cystic fibrosis patients from North-Eastern Italy”. Int. J. Immunogenet. 2010,
37(3):169-175.
▪ Segat L, Brandão LA, Guimarães RL, Pontillo A, Athanasakis E, de Oliveira RM, Arraes LC, de
Lima Filho JL, Crovella S. “Polymorphisms in innate immunity genes and patients response to
dendritic cell-based HIV immuno-treatment”. Vaccine. 2010, 28(10):2201-2206.
Congressi e Poster
▪ 30/08-02/09/2011: “Wellcome trust - The Genomics of Common Diseases 2011”, Cambridge (UK)
Poster: A New Approach To Study Mental Retardation With Next Generation Techologies
▪ 24/06/2008: “I° MDx Automation Day”, Bologna (IT), Beckman Coulter
▪ 09-10/06/2008: “3rd European Biomek User Summit”, Opio en Provence (FR), Beckman Coulter
Corsi di formazione e Attestati
▪ 02/10/2012: “Ion Torrent PGM Advanced User Certificate: Instrument operation & hardware, Quality
Control runs, Troubleshooting, basic on-instrument data review”, LifeTechnologies, Trieste (IT)
▪ 14/09/2012: “Aggiornamenti per l’analisi, l’elaborazione dei dati e troubleshooting della tecnica
MLPA”, MRC-Holland, Padova (IT)
▪ 06-08/08/2012: “Ion Torrent PGM Instrument training: One touch template preparation; Instrument
operation; Data evaluation; Library preparation”, LifeTechnologies, on site training, Trieste (IT)
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Corsi di formazione e Attestati
Emmanouil Athanasakis
▪ 07/06/2012: “Preparazione automatica dei campioni per Genomic Sequencing: dal Sanger alla Next
Generation”, Beckman Coulter, Milano (IT)
▪ 23-27/91/2012: “ANIS3 - International Winter School on Nano and Biotechnology”, Vipiteno (IT)
Poster: “Whole Exome Sequencing: a De Novo Study of Mental Retardation”
▪ 14/06/2010: Attestato d’apprendimento “Web of Science e Best Practice nell’attività di ricerca”,
Trieste (IT)
▪ 15/03/2010: Attestato di formazione per il ruolo di Amministratore di Biobanca “Biobanker: software
database posizionale per gestione di Biobanca”, AB Analitica, Trieste (IT)
▪ 11-15/01/2010: “ANIS2 - International Winter School on Nano and Biotechnology”, Vipiteno (IT)
▪ 19/05/2009: “DHPLC: aggiornamento, uso e manutenzione ”, Transgenomic, Padova (IT)
▪ 26-30/01/2009: “ANIS1 - International Winter School on Nano and Biotechnology”, Vipiteno (IT)
▪ 12/06/2008: “Nuove prospettive analitiche e protocolli per la DHPLC”, Transgenomic, Milano (IT)
▪ 21/12/2007: Attestato di istruzione “CustomArray Synthesizer operator training and Quality Control
testing of CombiMatrix ElectraSense synthesized slides”, Combimatrix, Trieste (IT)
▪ 01/03/2007: “Sistemi di pipettaggio manuali Gilson”, Gilson, Trieste (IT)
Missioni scientifiche
▪ 2011: “MarcoPolo 2011” – Popolazioni Isolate, presso la Regione di Crimea (UKR)
▪ 2009-2011: “Parco Genetico FVG” – Popolazioni Isolate, presso la regione FVG (IT)
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