08-Trascrizione II

Regolazione dell’espressione genica
Organizzazione della cromatina
Punto 1
Inizio della trascrizione
Gli rRNAs sono gli RNAs più abbondanti
nelle cellule.
Nelle cellule in attiva proliferazione
rappresentano l’80% dell’ RNA totale
I geni che codificano gli rRNA sono
presenti in copia multipla nel
genoma di tutti gli organismi
(7 copie in E. coli – 200 copie nell’uomo)
NTS = sequenza spaziatrice non trascritta
ETS = spaziatore esterno trascritto
ITS = spaziatore interno trascritto
Gli RNA 28S, 18S e 5,8S sono trascritti
contemporaneamente sotto forma di un
grande precursore (rRNA 45S)
dalla RNA polimerasi I
L’rRNA 5S è trascritto
dalla RNA polimerasi III
Maturazione degli rRNA
L’ rRNA 45S, nel nucleolo, viene prima
modificato chimicamente e successivamente
tagliato per dare origine agli rRNA maturi
Le modificazioni chimiche consistono nella
metilazione del ribosio e
nella modificazione dell’uridina a
pseudouridina
ad opera di complessi enzimatici (snoRNP)
snoRNP
snoRNAs + proteine
snoRNA =
small nucleolar RNAs
L’inizio della trascrizione da parte dell’RNA pol I è
controllato:
da un promotore che coincide con il sito d’inizio
della trascrizione;
da una sequenza posta a 5’ del promotore UCE
(upstream control element).
GTF1
L’ RNA pol I richiede due Fattori Generali
SL1 e UBF.
SL1 è costituito da TBP e da 3 TAF1
Importanza della sintesi
dell’rRNAs nelle cellule in attiva
proliferazione
Controllo della sintesi degli rRNA
nei processi neoplastici
tRNA
Nell’uomo troviamo 48 differenti tRNA
codificati da circa 500 geni
61 codoni – 20 aminoacidi – 48 tRNA
Alcuni tRNAs richiedono l’appaiamento
accurato delle basi soltanto nelle prime
due basi del codone e possono tollerare un
appaiamento errato in terza posizione
(tentennamento o wobble)
La trascrizione (RNA pol III)
e la maturazione dei tRNAs
avviene nel nucleoplasma
Modificazioni post-trascrizionali dei tRNA
• Eliminazione della sequenza al 5’
• Aggiunta di CCA al 3’
• Modificazione di alcune basi azotate
• In alcuni tRNA eliminazione di un piccolo
introne
I geni della III classe (trascritti dalla RNA pol III)
sono spesso caratterizzati da promotori interni al
gene.
Per i geni codificanti i tRNAs sono necessari 2 fattori
generali di trascrizione TFIIIB e TFIIIC.
TFIIIB è costituito da TBP e da almeno un TAF3.
Nella trascrizione dell rRNA 5S interviene
un terzo fattore TFIIIA.