crs educational: crs microarrays 1

CENTRO RICERCHE SCIENTIFICHE
DOTT. DINO PALADIN
ADVANCED BIOTECHNOLOGIES
www.abnanotec.com
CRS EDUCATIONAL: CRS MICROARRAYS 1
I MICROARRAYS E LO STUDIO DELLA FARMACORESISTENZA
NEL CASO DEL TUMORE ALLA MAMMELLA
La tecnologia dei microarrays può trovare applicazione nella ricerca genomica funzionale:
permette di analizzare simultaneamente migliaia di geni e di quantificarne i livelli di espressione
relativa.
Nell’ambito della salute umana e della terapia, le conoscenze che derivano da questo tipo di
studi possono aiutare a definire le cause e le conseguenze di una particolare patologia, a capire
come i farmaci agiscono nelle cellule e nell’organismo e quali prodotti genici potrebbero essere
utilizzati come agenti terapeutici: i microarray trovano diretta applicazione per gli studi sulla
resistenza ai farmaci antitumorali.
La farmacoresistenza è la causa più frequente del fallimento della chemioterapia in pazienti
oncologici.
Finora la ricerca ha permesso di identificare numerosi geni coinvolti
nello sviluppo del fenotipo resistente, di definire il loro meccanismo
d’azione e di regolazione nei tessuti normali e tumorali. Gli studi di
espressione di tali geni hanno un significato prognostico e predittivo
sull’efficacia della chemioterapia.
Lo studio dei meccanismi che inducono la resistenza permette
all’oncologo di conoscere se il tumore è resistente e quali forme di
resistenza sono eventualmente presenti; tale conoscenza consente di
procedere ad un miglioramento dei protocolli terapeutici.
Il microarray ad oligonucleotidi (ad elevata densità) è il sistema d'indagine qui proposto per
lo studio della farmacoresistenza in campioni clinici di tumore mammario. Consente l’analisi
quantitativa dell'espressione genica di un elevato numero di geni (da 5.000 a 10.000).
Dall'analisi del profilo di espressione di queste popolazioni è possibile identificare un sottogruppo di
geni, marcatori della farmacoresistenza, caratteristici per quel tipo tumorale; tali marker vengono poi
studiati mediante l’analisi statistica per valutare il loro valore predittivo nella risposta alla
chemioterapia.
DURANTE L’ESERCITAZIONE LO STUDENTE HA L’OPPORTUNITA’ DI COMPRENDERE:
•
Cos’è un microarray e come si studiano geni differenzialmente espressi nel
caso specifico del tumore alla mammella
•
Le singole fasi per la preparazione del campione biologico (biopsia di tumore
mammario) per l’analisi al microarray
La presentazione, mediante un approccio sperimentale semplice, facilita la didattica delle
scienze, in particolare negli aspetti riguardanti le biotecnologie e le applicazioni nell’ambito
della ricerca medica.
Sede Operativa: C.R.S. Centro Ricerche Scientifiche
Laboratorio:
Via Svizzera 16 -35127 PADOVA
Via IV Novembre, 68
Tel 049-760191 - Fax 049-8709510
31045 Motta di Livenza (TV)
Distribuito da AB ANALITICA srl – www. abanalitica.it
ST CRSMicroarray1 190405.doc
CRS EDUCATIONAL: CRS MICROARRAYS 1
DESCRIZIONE DEL PRODOTTO
Viene fornito ai docenti e agli studenti un CD ROM con una presentazione che spieghi in maniera semplice ed
esaustiva cos’è un microarray, come si procede per la sintesi di un chip/microarray, le possibili applicazioni di
tale tecnologia nell’ambito della ricerca medica ed in particolare nello studio di geni differenzialmente espressi
nella farmacoresistenza nel caso del tumore alla mammella.
Vengono spiegate in maniera dettagliata tutte le fasi di preparazione del campione da analizzare con il
microarray, la strumentazione necessaria per tale analisi e come si procede all’analisi finale dei dati ottenuti
con un microarray.
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CRS EDUCATIONAL: CRS MICROARRAYS 1
CARATTERISTICHE DEL PRODOTTO
►
I prodotti della linea CRS EDUCATIONAL sono rivolti a docenti e studenti universitari,
per la formazione universitaria, post-universitaria e per l’aggiornamento professionale.
►
Obiettivi dell’esperienza: conoscenza della tecnica dei microarrays e dello studio
dell’espressione genica e possibili applicazioni nell’ambito della ricerca medica.
►
Il prodotto è costituito da:
un CD ROM per l’insegnante e lo studente: una presentazione che funge da vera e
propria traccia per una lezione teorica e per una eventuale esercitazione pratica
sperimentale. Saranno mostrati dei link dinamici relativi ad alcune fasi
dell’allestimento di un esperimento di microarray, con i protocolli relativi ai diversi step
per la sintesi di un chip/microarray e la preparazione del campione da analizzare; sarà
inoltre data ampia spiegazione sugli strumenti utilizzati per tale analisi.
RIFERIMENTI BIBLIOGRAFICI
M. J. van de Vijer et al., A gene expression signature as a predictor of survival in breast cancer; The New
England Journal of medicine, vol. 347, n° 25, December 19, 2002, pp. 1999-2009
M. West et al., Predicting the clinical status of human breast cancer by using gene expression profiles; PNAS,
September 25,2001, vol. 98, n° 20, pp. 11462-11467
J. J. W. Chen, R. Wu et al., Profiling expression patterns and isolating differentially expressed genes by cDNA
microarray system with colorimetric detection; Genomics, vol. 51, pp. 313-324, 1998
J. Khan, L. H. Saal et al., Expression profiling in cancer using cDNA microarray; Electrophoresis, vol. 20, pp.
223-229, 1999
K. Nooter, G. B. Riviere et al., The prognostic significance of expression of the multidrug resistance-associated
protein (MRP) in primary breast cancer; British Journal of Cancer, vol. 76 (4), pp. 486-493, 1997
J. Robert, Resistance to anticancer drugs: are we ready to use biological information for the treatment of
patients with cancer?; Therapeutic Drug Monitoring, vol. 20, pp. 581-587, 1998
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IL FUTURO DELLA RICERCA PER MIGLIORARE IL
NOSTRO DOMANI
“La scienza non può stabilire dei fini e tanto meno inculcarli negli esseri umani; la
scienza, al più, può fornire i mezzi con i quali raggiungere certi fini. Ma i fini stessi
sono concepiti da persone con alti ideali etici.”
Albert Einstein, Pensieri degli anni difficili
I prodotti CRS EDUCATIONAL rappresentano una risposta alle esigenze delle strutture di
formazione che dovendo operare con numerosi allievi, non sempre hanno a disposizione
risorse di personale e di tempo per confezionare il materiale necessario per ogni studente.
La linea CRS EDUCATIONAL consente di toccare con mano la realtà dell’innovazione
tecnologica relativamente alle scienze biologiche.
Pensati e studiati da persone con consolidata esperienza nell’ambito della ricerca e della
diagnostica molecolare, i kit rappresentano per lo studente una concreta chiave
interpretativa di una teoria spesso considerata lontana e astratta.
Il nostro obiettivo è fornire ai docenti degli strumenti utili
a stimolare negli studenti capacità critica e curiosità
metodologiche verso le tematiche proposte in classe.
Gli esperimenti proposti permetteranno agli studenti di
valutare le implicazioni nella vita e nelle attività umane,
dei più moderni metodi d’indagine scientifica legati alla
diagnostica medica e alle biotecnologie.
CODICE
PRODOTTO
FORMATO
DEL KIT
DESCRIZIONE
23-01
CRS REAL TIME 1
Quantificazione di un gene housekeeping
20-30
STUDENTI
23-02
CRS GENETICA 1
Determinazione della predisposizione genetica alla
celiachia
20-30
STUDENTI
23-03
CRS GENETICA 2
Typing molecolare ed ereditarietà
20-30
STUDENTI
23-04-CD
CRS MICROARRAYS 1
I microarrays e lo studio della farmacoresistenza nel caso
del tumore alla mammella
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31045 Motta di Livenza (TV)
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