Documento allegato - Policlinico S.Orsola

Daniela Barbieri, [email protected], tel. +39 347 3140650
Curriculum vitae
INFORMAZIONI PERSONALI
Nome: Daniela
Cognome: Barbieri
Luogo e Data di nascita: Medicina (BO) il 05/06/1985
Cittadinanza: Italiana
Stato civile: Nubile
Residenza: via Bottrigara 491/B, 40059 Medicina (BO)
Telefono: +39 347 3140650
Patente: categoria B (Automobile propria)
e-mail: [email protected]
posta certificata: [email protected]
ISTRUZIONE e FORMAZIONE
Gennaio 2014: Iscritta al Master in Biostatistica (II livello), Università di Bologna (1 anno).
02/03 Dicembre 2013. Corso per Junior CRAs organizzato dall’European Center for Clinical Research
Training (ECCRT), sede di Milano. Nozioni su ICH-GCP, Sviluppo di farmaci, Documenti essenziali,
Monitoring, Documentazione di ricerca, Report dell’evento avverso.
Dal 20 Giugno al 21 Dicembre 2012 (6 mesi): visiting student presso il German Cancer Research
Center (DKFZ) di Heidelberg, Germania. Ricerca svolta nell’ambito del Dottorato, nella Divisione Viral
Transformation Mechanisms, Program Infection and Cancer, laboratorio diretto dal Dr. Prof. Frank Rösl,
sotto la supervisione del Dr. Bladimiro Rincon Orozco. Tema: interazione tra HPV e sistema immunitario.
Dal 1 Gennaio 2010 al 31 Dicembre 2012: Dottoranda con borsa di studio ministeriale nella Scuola di
Dottorato in Scienze Biomediche: progetto n.1 “Biotecnologie Mediche” (XXV ciclo), Università di
Bologna. Settore Concorsuale di Afferenza: 06/A3 e Settore Scientifico Disciplinare: MED/07.
Attività svolta presso il Dipartimento di Ematologia e Scienze Oncologiche "L. e A. Seragnoli", c/o U.O.
Microbiologia, Laboratorio di Virologia, Ospedale S. Orsola-Malpighi, Bologna. Tema: marker molecolari
nella diagnosi dei tumori della cervice uterina e del distretto testa-collo HPV-associati. Discussione svolta il
10/05/2013. Relatore: Prof.ssa Marialuisa Zerbini – Supervisore del progetto: Dr.ssa Simona Venturoli.
Ottobre 2009: Laurea Specialistica in Biotecnologie Farmaceutiche, Università di Bologna (classe 9/S).
Tirocinio svolto presso il Centro de Biologia Molecular “Severo Ochoa”, CSIC-UAM, Madrid, Spagna
(Marzo-Agosto 2009, 6 mesi); laboratorio Retrotrascrittasi di HIV e terapia antiretrovirale. Tesi: “Effect of the
amino acid substitution R78A on HIV-1 group O reverse transcriptase thermal stability and copying fidelity”.
Relatore: Prof. Giorgio Gallinella. Correlatore: Dr. Luis Menéndez-Arias. Voto: 110/110 e Lode.
Ottobre 2007: Laurea in Biotecnologie curriculum farmaceutico, Università di Bologna (classe L1).
Tirocinio svolto presso i laboratori di Tossicologia Cellulare e Genetica del Dipartimento di Farmacologia
dell’Università di Bologna (Aprile-Luglio 2007, 4 mesi). Tesi: “SNPs metabolici come determinanti genetici
della risposta all’esposizione a tossici ambientali”.
Relatore: Prof.ssa Patrizia Hrelia. Correlatore: Dr.ssa Sabrina Angelini. Voto: 110/110 e Lode.
Giugno 2004: Diploma di Istruzione Secondaria Superiore (indirizzo PNI) ottenuto presso il Liceo
Scientifico Statale “G.Bruno” di Budrio (BO) – Voto: 100/100.
LINGUE CONOSCIUTE (Common European Framework of Reference for Languages)
Lingua madre: Italiano
Comprensione
Altre lingue:
Autovalutazione
European Level
Ascolto
Lettura
Orale
Interazione
Scritto
Produzione
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sensi della vigente normativa sulla riservatezza D.lgs 196/03
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Daniela Barbieri, [email protected], tel. +39 347 3140650
ESPERIENZE LAVORATIVE PRECEDENTI ed ISCRIZIONE ad ASSOCIAZIONI
Gennaio-Giugno 2014. Contratto di cessione dei diritti d’autore per la casa editrice Bononia University
Press S.p.a. (BUP).
Da Febbraio 2013 ad oggi: Biotecnologo post-dottorato presso l’U.O. Microbiologia, Ospedale S.
Orsola-Malpighi, Università di Bologna. Attività di laboratorio e di gestione/elaborazione statistica di
database riguardo vari progetti del laboratorio di Virologia. In particolare:
- Esecuzione di HPV DNA test ed elaborazione statistica del database riguardante le analisi Pap-test e
ricerca di HPV DNA nell’ambito del progetto più ampio “Sostegno al Ministero della Sanità del Sud Africa
per la realizzazione del programma nazionale di risposta globale all’HIV/AIDS nelle zone di confine tra
Sudafrica, paesi circostanti e in regioni di sviluppo selezionate” gestito dall’Istituto Superiore di Sanità
di Roma. Supervisore: Dr.ssa Simona Venturoli.
- Ricerca di nuovi marker molecolari per la diagnosi di tumori associati ad HPV. Supervisore: Dr.ssa
Simona Venturoli.
- Collaborazione con il Gruppo di Ricerca per le applicazioni industriali dei Gas Palsma del Dipartimento
di Ingegneria Industriale (DIIN/CIRI-MAM) per la valutazione delle applicazioni biomediche di nuove
sorgenti gas plasma. Supervisori: Prof.ssa Maria Paola Landini e Prof. Vittorio Colombo.
Dal 2012 ad oggi: iscritta all’Albo dei Biotecnologi Italiani, sezione Biotecnologie Mediche (A.N.B.I.).
CAPACITÀ E COMPETENZE TECNICHE
ALLESTIMENTO E MANTENIMENTO DI COLTURE CELLULARI BATTERICHE ED EUCARIOTICHE.
Esperienza con Escherichia coli e linee cellulari CaSki, SiHa, HeLa, C33a, Cal27, SCC25, VERO, CHO.
ESTRAZIONE DI ACIDI NUCLEICI. DNA plasmidico da batteri con kit commerciali (Fermentas o Promega);
DNA e RNA da cellule in coltura o campioni clinici (biopsie FFPE, urine, cervical swabs, sangue intero,
plasma, siero) con kit commerciali manuali (Qiagen o Ambion) o sistemi automatici quali NucliSens
®
EasyMag (bioMérieux) e m2000 (Abbott).
®
DOSAGGIO DI ACIDI NUCLEICI e PROTEINE. Spettrofotometro UV/Vis classico, Nanodrop (ND-1000
UV/Vis Spectrophotometer); Bradford protein Assay.
PURIFICAZIONE di PROTEINE con His6-TAG. Da lisato batterico con cromatografia a scambio ionico
2+
(colonna di cellulosa fosfato) e cromatografia di affinità (colonna di Ni ).
BIOLOGIA MOLECOLARE. PCR, PCR-RFLP, Real Time-PCR (strumentazione: Corbett Rotorgene 3000,
Qiagen Rotorgene Q, BioRad CFX96 Touch system e piattaforme Applied Biosystems), RT-PCR, RT-qPCR,
NASBA (kit EasyQ, bioMérieux), Helicase-Dependent Amplification (kit BioHelix); studi di metilazione in siti
CpG con PCR seguita da sequenziamento per la ricerca di marcatori diagnostici di patologia. Analisi di
proteine mediante Western Blotting.
SEQUENZIAMENTO DNA. Pyrosequencing (Piattaforma Pyromark Q24 QiAGEN e relativi software).
DIAGNOSTICA PER HPV, Parvovirus B19, Polyomavirus BKV e JCV. Test per ricerca di HPV DNA hc2
®
(Qiagen), Cervista (Hologic) e RealTime HPV (Abbott), genotipizzazione mediante INNO-LiPA HPV
Genotyping Extra assay (Innogenetics) e HPVsign® Genotyping test (Qiagen); kit commerciali Nanogen per
Polyomavirus e home-made real time-PCR per Parvovirus B19.
CAPACITÀ E COMPETENZE INFORMATICHE
Buona conoscenza dei prodotti Microsoft (Windows e pacchetto Office) e dei principali database/tools
bioinformatici internazionali (es. NCBI, PubMed, Primer Blast, SwissProt e Web of Science).
®
TM
Software Quantity One 1-D per l’uso del sistema di imaging molecolare VersaDoc (Bio-Rad).
Software Clone Manager (Sci-Ed Software).
Software GraphPad Prism 5 e conoscenza base del software open-source R per l’elaborazione e l’analisi
statistica dei dati.
PUBBLICAZIONI (H index=2, source Web of Science®)
1. “Detection of HPV16 African variants and quantitative analysis of viral DNA methylation in
oropharyngeal squamous cell carcinomas”. Barbieri D, Nebiaj A, Strammiello R, Agosti R, Sciascia S,
Gallinella G, Landini MP, Caliceti U, Venturoli S. J Clin Virol (Accepted Manuscript – Article in press
2014).
2. “Detection of high risk Human Papilloma Virus type 16 and 18 using the Isothermal Helicase-Dependent
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Daniela Barbieri, [email protected], tel. +39 347 3140650
3.
4.
5.
6.
Amplification”. Barbieri D, Venturoli S, Rosl Frank, Rincon-Orozco B. Diagn Microbiol Infect Dis,
(Accepted Manuscript – Article in press 2014)
“Comparison of HPV sign Genotyping Test with INNO-LiPA HPV Genotyping Extra assay on histologic
and cytologic cervical specimens”. Barbieri D, Nocera M, Gallinella G, Gentilomi GA, Plazzi M, Costa
S, Santini D, Venturoli S. Diagn Microbiol Infect Dis, (2012) Sep;74(1):43-8. Citato 2 volte.
“Factors predicting the outcome of conservatively treated adenocarcinoma in situ of the uterine cervix:
an analysis of 166 cases”. Costa S., Venturoli S., Negri G., Sideri M., Preti M., Pesaresi M., Falasca A.,
Barbieri D., Zerbini M., Santini D., Sandri MT., Ghiringhello B., Caroppo Venturini N., Syrjanen S.,
Syrjanen K. Gynecologic Oncology 124 (2012) 490-495. Citato 2 volte
“Comparison of Abbott RealTime High Risk HPV and Hybrid Capture 2 for the detection of high-risk
HPV DNA in a referral population setting”. Venturoli S., Leo E., Nocera M., Barbieri D., Cricca M.,
Costa S., Santini D., Zerbini M. Journal of Clinical Virology 53 (2012) 121-124. Citato 6 volte
“Thermostable HIV-1 group O reverse transcriptase variants with the same fidelity as murine leukaemia
virus reverse transcriptase”. Barrioluengo V., Alvarez M., Barbieri D. and Menéndez-Arias L.
Biochemical Journal 436 (2011) 599-607. Citato 10 volte
Correlatrice di tesi per il Corso di Laurea Specialistica Europea in CTF dell’Università di Bologna.
ATTI DI CONVEGNI NAZIONALI ED INTERNAZIONALI
1. FIRST ANNUAL MEETING OF COST ACTION ELECTRICAL DISCHARGES WITH LIQUIDS FOR
FUTURE APPLICATIONS 2014, Lisbona. “INVESTIGATION OF THE EFFECTIVENESS OF A LOW
POWER INDUCTIVELY COUPLED PLASMA SOURCE FOR BIOMEDICAL APPLICATIONS”. V.
Colombo, G. Anceschi, D. Barbieri, M. Boselli, F. Cavrini, E. Ghedini, M. Gherardi, M. P. Landini, R.
Laurita, A. Liguori, P. Sanibondi, A. Stancampiano. Comunicazione Orale
2. EUROGIN 2013, Firenze. “Virological markers in HPV-driven oropharyngeal squamous cell carcinoma:
HPV16 variants detection and quantitative analysis of viral DNA methylation”. Barbieri D, Nebiaj A,
Strammiello R, Agosti R, Sciascia S, Gallinella G, Landini MP, Caliceti U, Venturoli S. Comunicazione
Orale, sessione Head & Neck 1.
th
3. 15 Annual Meeting of ESCV 2012, Madrid. “A loop mediated isothermal amplification (LAMP) assay
to detect viral DNA in clinical specimens”. Gallinella G., Barbieri D., Bonvicini F., Kerr S., Zerilli F., Di
Furio F., Manaresi E. (collaborazione con Biotrin International, Dublino, Irlanda) Comunicazione Orale
4. EUROGIN 2012, Praga. “HPV 16 DNA methylation in cervical adenocarcinoma and oropharyngeal
squamous cell carcinoma”. Barbieri D. e Venturoli S. Comunicazione Orale
5. PASCV 2012, Florida, USA. “An evaluation of a loop-mediated isothermal amplification assay for the
detection of BK virus in clinical samples”. Venturoli S., Barbieri D., Kerr S., Keating G., Adlerstein D.,
Gallinella G. (collaborazione con la ditta Biotrin International, Dublino, Irlanda). Poster
6. 40° Congresso AMCLI 2011, Rimini. “Genotipizzazione virale e altri markers molecolari nella diagnosi
dei tumori dell’orofaringe HPV associati”. Barbieri D., Venturoli S., Nocera M., Caliceti U., Nejbia A.,
Agosti R., Zerbini M. Poster
rd
7. 3 International Conference on Viral Oncology Research 2011, Napoli. “HR-HPV genotyping and
other molecular markers in cervical adenocarcinoma”. Barbieri D., Venturoli S., Nocera M., Costa S.,
Santini D., Rivasi F., De Lillo M., Nannini R., Nuzzo F., Zerbini M. Poster
8. XI Spanish National Congress on Virology 2011, Granada, Spain. “Influece of the amino acidic
substitutions K65R, V65I and R78A on HIV-1 group O reverse transcriptase copying fidelity and thermal
stability”. Barrioluengo V., Alvarez M., Barbieri D., Menéndez-Arias L. Poster
th
9. 27 International Papillomavirus Conference - HPV 2011, Berlin, Germany. “Triaging ASC-US pap
smear with colposcopy: data from the PATER study”. Costa S., Venturoli S., Marcellusi A., Garganese
G., Favato G., Pennini FS., Barbieri D., Pesaresi M., Falasco A., Zerbini M. Poster
10. 38° Congresso SIM 2010 , Riccione. “Tipizzazione del DNA di HPV e altri markers molecolari nello
studio di adenocarcinomi cervicali invasivi”. Barbieri D., Venturoli S., Costa S., Santini D., Nocera M.,
Cricca M., Alessandrini F., Gallinella G., Musiani M., Zerbini M. Poster
11. 39° Congresso AMCLI 2010 , Rimini. “Prevalenza di HPV in donne trattate per CIN2+ e valutazione
della persistenza virale e degli mRNA E6/E7 nel follow-up”. Barbieri D., Venturoli S., Costa S., Leo E.,
Nocera M., Alessandrini F., Musiani M., Zerbini M. Poster
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ASPIRAZIONI PROFESSIONALI e AREE DI INTERESSE
Sono una persona molto curiosa e volenterosa. Mi piacciono le nuove sfide e lavorare in gruppo,
condividendo esperienze e conoscenze con i colleghi.
Nel campo della ricerca farmaceutica e medica applicate mi interessano maggiormente gli studi su
farmacogenetica/tossicogenetica, studi pre-clinici e clinici, rigenerazione tissutale e messa a punto di metodi
di biologia molecolare per il miglioramento della diagnostica sia in campo microbiologico che non.
Bologna, 02/05/2014
In fede
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